Auxonne est une ancienne place forte qui joua un rôle militaire jusqu'au XIXè siècle. La très massive tour Notre-Dame est un des vestiges de la forteresse Louis XI (XVè siècle, nommée aujourd'hui le "château"). Elle abrite le musée Bonaparte, sur quatre niveaux (le dernier est une plate-forme d'artillerie couverte d'une charpente au XVIIIè siècle.).
Bonaparte fut élève à l'Ecole d'Artillerie d'Auxonne de 1788 à 1791. Le musée expose des objets personnels qui appartenaient au jeune lieutenant Bonaparte, lorsqu'il séjournait à Auxonne, ainsi que du mobilier, des armes du Premier et Second Empire et des éléments d'histoire locale.
La chambre que Napoléon Bonaparte a occupée aux Casernes en 1791 appartient au domaine militaire. Elle est aussi à Auxonne mais sa visite nécessite une autorisation préalable (contacter l'Office de Tourisme au 03.80.37.34.46).

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