L'église de Maisonnisses, située au centre du bourg, est de style architectural très simple (datant du XIIIe siècle, elle montre simplicité et aussi influence du premier gothique) et pourtant elle fut église de l'ancienne Commanderie de l'Ordre de Malte de Maisonnisses.

L'église St-Jean-Baptiste de Maisonnisses abrite, dans un enfeu, un monument funéraire remarquable et bien conservé. Ce monument qui semble dater du XIVe siècle a été retrouvé dans un champ par un laboureur au XIXe siècle et a été remis à sa place dans l'église. Il s'agit d'un sarcophage gravé d’une épée et portant un gisant finement sculpté dans le calcaire. C'est probablement la sépulture d’un chevalier de l’Ordre de Malte car le gisant a les pieds appuyés sur un chien, marque de noblesse.

L'église est construite au-dessus d'une jolie petite crypte qui peut aussi être visitée.